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Vergleichende Untersuchungen zu antibiotikaresistenten, pathogenen Bakterien von pflanzlichen und tierischen Lebensmitteln aus Nigeria und Deutschland
Projekt
Förderkennzeichen: MRI-MBT-08-1040 Bakterien Nigeria-Deutschland
Laufzeit: 01.03.2017
- 28.02.2018
Forschungszweck: Angewandte Forschung
Ziel dieser Untersuchungen ist es die Einträge von antibiotikaresistenten Bakterien und die Verbreitung von Resistenzgenen, besonders von Staphylococcus (Methicillin-resistente Staphylococcus aureus-MRSA), Escherichia coli (ESBL-Escherichia coli, E. coli O157:H7 und andere Pathotypen, und Salmonella-Arten wie z.B. Salmonella Enteritidis und Salmonella Typhimurium, in pflanzlichen und tierischen Frischeproduktketten in Nigeria und Deutschland zu untersuchen. Weiterhin sollen antibiotikaresistente Bakterien genotypisch identifiziert werden. Weiterhin sollen die Genome ausgewählter resistenter Bakterien vollständig sequenziert werden.
Bisher wurden etwa 400 Bakterien aus pflanzlichen und tierischen Produkten isoliert und grob phänotypisch charakterisiert um diese vorläufig zu identifizieren. Die Antibiotikaresistenzen der 400 Stämme wurden mittels der Plättchendiffusion-Methode überprüft. Von den 400 Stämmen wurden etwa 100 Stämme genauer untersucht und mit Hilfe genetischer Methoden (16S rRNA-Gensequenzierung und PCR Typisierung) identifiziert. Die genomische DNA von 25 Stämmen aus pflanzlichen Lebensmitteln wurde vollständig sequenziert. Die ersten Ergebnisse wurden kürzlich publiziert: Igbinosa, E., Rathje, J., Habermann, D., Brinks,, E., Cho, G.-S., Franz, C.M.A.P. 2018. Draft genome sequence of multidrug-resistant strain Citrobacter portucalensis MBTC-1222, isolated from Uziza (Piper guineense) leaves in Nigeria. Genome Announcements 6(9), e00123-18.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Verfahrenstechnik Lebensmittel
- Biotechnologie
- Lebensmittelmikrobiologie
Rahmenprogramm
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
MRI - Institut für Mikrobiologie und Biotechnologie (MRI-MBT)