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Entwicklung, Optimierung und Validierung PCR basierter Nachweis- und Typisierungstechniken für Bakterien der Gattung Yersinia
Projekt
Förderkennzeichen: BfR-BIOS-08-1322-217
Laufzeit: 01.02.2007
- 31.12.2008
Forschungszweck: Angewandte Forschung
PCR Techniken zur Feintypisierung von pathogenen Bakterien wie MLST, AFLP und MLVA besitzen hohe Diskriminierungseigenschaften und sind schnell und vergleichsweise einfach durchzuführen. Die AFLP-Technik und die MLVA-Technik sollen zur Charakterisierung von Yersinia-Stämmen angewandt werden. Die Untersuchungen werden mit Yersinia-Stämmen, die ein konjugatives Typ IV System besitzen, durchgeführt. Gleichzeitig werden auch Stämme der verschiedenen pathogenen Bioserovare von Y. enterocolitica in die Methoden-entwicklung einbezogen, um die Techniken für das Yersinia-Konsiliarlabor verfügbar zu machen.Wir untersuchen ein konjugatives Typ IV System aus Yersinia enterocolitica, das eine hohe Verwandtschaft zu TypIV Sekretionssystemen anderer gramnegativer Bakterien aufweist. Das Ziel ist, herauszufinden, ob Resistenzgene oder Pathogeni-tätsgene durch dieses System in der Gattung Yersinia verbreitet werden. Für die Untersuchung wurden Stämme aus klinischen Geschehen, aus Tieren (weitgehend Schwein) und Lebensmitteln verwendet. Typ IV tragende Yersinia stämme gehören dem Biovar 1A von Y. enterocolitica biovar 1A an, sowie zu den Spezies Y. kristen-senii and Y. frederiksenii. In Kooperation mit dem VLA Weybridge, UK, untersuchen wir nun potentiell pathogene Y. enterocolitica Biovar 1A, die aus Durchfallerkrankun-gen stammen. PFGE- Analysen von Typ IV tragenden Stämmen zeigen eine wesent-lich größere Heterogenität als Stämme, die zu den klassischen pathogenen Biosero-varen angehören. Hybridisierungen ergaben, dass das TypIV System auf Plasmiden lokalisiert ist.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Lebensmittelmikrobiologie
- Toxikologie