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Referenzgenome für den Chinesischen Barsch (Siniperca chuatsi), den Flußbarsch (Perca fluviatilis) und drei verwandte Fischarten der Familie Sinipercidae für komparative Genomik und markergestützte Zucht in der Aquakultur
Projekt
Förderkennzeichen: 324050651
Laufzeit: 01.01.2017
- 31.12.2019
Forschungszweck: Grundlagenforschung
Siniperca chuatsi, auch bekannt als Mandarinfisch oder Chinesischer Barsch, ist ein hochwertiger Aquakulturfisch, dessen Produktion in China seit 20 Jahren kontinuierlich wächst. Ziel dieses Projektes ist die Bereitstellung qualitativ hochwertiger Referenzgenome für Siniperca chuatsi und andere Mitglieder der Familie Sinipercidae (S. kneri, S. scherzeri und C. whiteheadi). Dieses internationale Projekt wird ergänzt durch die Genomassemblierung des Flussbarsches (Perca fluviatilis) als einer nahe verwandten Species von zukünftigen Interesse in der europäischen Aquakultur. Die Sequenzdaten werden sowohl für komparative Genomik innerhalb der Sinipercidae/Percidae, als auch für Vergleiche mit den Genomen von evolutionär weiter entfernten Barschverwandten verwendet. In diesem Zusammenhang sollen bioinformatische Strategien entwickelt werden, welche Multi-Species Genomvergleiche auf der Ebene von chromosomaler Kolinearität sowie Gen- und Nukleotidebene kombinieren. Mit Hilfe dieser bioinformatorischen Werkzeuge sollen biologische Fragestellungen hinsichtlich Wachstum, Toleranz gegenüber Salzgehalt und zur Geschlechtsdifferenzierung beantwortet werden.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Seefischerei
- Genetische Ressourcen
- Marikultur
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
Leibniz-Institut für Gewässerökologie und Binnenfischerei (IGB)
