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SYNBREED T1: Genomweite Hochdurchsatz-Resequenzierung bei Huhn, Rind und Mais
Projekt
Förderkennzeichen: 0315526
Laufzeit: 01.01.2009
- 31.12.2014
Forschungszweck: Grundlagenforschung
Hochparallele Sequenziertechniken (next generation sequencing NGS) ermöglichen die Sequenzierung komplexer Genome in überschaubaren Zeiträumen zu Kosten, die weit unter denjenigen herkömmlicher Sequenziertechnologie liegen. Durch Investitionen aus dem Innovationscluster und aus Eigenmitteln soll die bereits am HMGU etablierte Infrastruktur zu NGS Technologien gezielt ausgebaut werden. Die Geräte erlauben sowohl die Identifizierung von Basenpaaraustauschen (SNPs) als auch von Kopienzahlvarianten (copy number variants CNVs). Die geplanten Sequenzierungen von DNA-Pools und Einzelindividuen bei Huhn, Rind und Mais bilden die Grundlage für die Identifizierung von Sequenzpolymorphismen für die Erstellung von SNP-Arrays, liefern Beiträge zur Vervollständigung der Genomsequenzen von Huhn, Rind und Mais und bilden neben den Hochdurchsatz-Genotypisierungsdaten die Datengrundlage für das Anwendungsprojekt Populationsgenomik (A4).
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenzüchtung
- Tierzucht
