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Impressum
SYNBREED A3: Genomische Leistungsvorhersage in der Hybridzucht und für gezielte Paarungen
Projekt
Förderkennzeichen: 0315528D
Laufzeit: 01.09.2009
- 31.08.2014
Fördersumme: 1.822.688 Euro
Forschungszweck: Grundlagenforschung
Die Vorhersage der Leistung ungeprüfter Hybriden in der Kreuzungszucht und gezielter Anpaarungen in der Reinzucht ist von großer Bedeutung für die Effizienz von Zuchtprogrammen. Bislang basierte die Leistungsvorhersage ausschließlich auf der phänotypischen Information von Verwandten und war deshalb sehr ressourcenaufwändig bei begrenzter Genauigkeit. Ausgehend von ersten experimentellen Ergebnissen zur Anwendung von „'genomic selection' in der Reinzucht erscheint es daher sehr aussichtsreich, einen Paradigmenwechsel in der Pflanzen- und Tierzüchtung zu vollziehen und die phänotypische Leistungsvorhersage durch eine genomische Leistungsvorhersage zu ergänzen oder gar zu ersetzen. Im Falle von Kreuzungen müssen hierbei neben additiven Geneffekten auch Dominanz, Epistasie und epigenetische Phänomene berücksichtigt werden. In A3 sollen deshalb zunächst quantitativ-genetische Modelle zur Berücksichtigung dieser diversen Effekte abgeleitet werden. Durch SNP-Genotypisierung und praxisübliche Phänotypisierung werden bei Mais, Huhn und Rind geeignete Datensätze erzeugt, die mit Hilfe der in A1 entwickelten statistischen Verfahren analysiert werden. Zur Bewertung der Genauigkeit der genomischen Leistungsvorhersage und der Umweltsensitivität von SNP-Schätzwerten dienen die in A1 untersuchten Kreuzvalidierungsmethoden. Beim Huhn werden genomische Daten und in T4 entwickelte Biomarker zur Vorhersage der Schlupffähigkeit kombiniert. Zusätzlich werden simulierte Daten verwendet, um den Einfluss wichtiger Faktoren wie Markerdichte und Verwandtschaftsstruktur auf die Güte der genomischen Leistungsvorhersage zu erforschen. Aufgrund der Ergebnisse sollen Strategien für die optimale Integration der genomischen Leistungsvorhersage in Zuchtprogramme bei den untersuchten Spezies und generell in der Pflanzen- und Tierzüchtung abgeleitet werden.
Unterprojekte:
A3.1: Genomische Leistungsvorhersage bei Mais
A3.2: Genomische Leistungsvorhersage beim Huhn
A3.3: Genomische Leistungsvorhersage beim Rind
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Pflanzenzüchtung
- Tierzucht
Verbundprojekt
Ausführende Einrichtung
Institut für Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik (UH-350)
