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MALDI-TOF MS-basierte Mikroorganismen - Identifizierung aus komplexen Proben

Projekt

Ernährung und Verbraucherschutz

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Ernährung und Verbraucherschutz


Förderkennzeichen: BfR-BIOS-08-1322-410
Laufzeit: 01.04.2009 - 31.12.2009
Forschungszweck: Angewandte Forschung

Die MALDI-TOF Massenspektrometrie wird derzeit aufgrund ihrer Schnelligkeit und Automatisierbarkeit intensiv für die mikrobiologische Diagnostik evaluiert. Zwei Probleme verhinderten bisher die weiterreichende Anwendung in der klinischen und veterinären Diagnostik. Zum einen weist die Methode in ihrem ursprünglichen Fingerprint-basierten Ansatz als phänotypische Methode eine gewisse Abhängigkeit von experimentellen und biologischen Faktoren und damit eingeschränkte Reproduzierbarkeit und Spezifität auf. Zum anderen beruht die Methode im Wesentlichen auf der Analyse bakterieller Reinkulturen, die zeitaufwändige Isolierungsprozeduren erfordert. Das Projektziel besteht darin, die Methode dahingehend zu erarbeiten und zu prüfen, inwieweit durch Kopplung von immunomagnetischen Anreicherungstechniken mit MALDI-TOF MS unter Verwendung des spezifischeren Bioinformatischen Ansatzes eine sensitive und spezifische MS-basierte Mikroorganismen-Bestimmung direkt aus komplexen Proben möglich ist.

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