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Methodenharmonisierung für das Monitoring von VTEC und Subtypisierung von stx2-Gene

Projekt

Ernährung und Verbraucherschutz

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Ernährung und Verbraucherschutz


Förderkennzeichen: BfR-BIOS-08-1322-443
Laufzeit: 01.04.2010 - 31.12.2010
Forschungszweck: Angewandte Forschung

Die Mitgliedstaaten der Europäischen Union sind laut Richtlinie 2003/99/EG (EG, 2003) zur Erhebung einschlägiger, vergleichbarer Daten über das Vorkommen von Verotoxin-bildenden E. coli (VTEC) in Tieren und Nahrungsmitteln verpflichtet. Aus diesem Grund sind, basierend auf einem Gutachten des wissenschaftlichen Gremiums für biologische Gefahren (im Auftrag der EFSA), einheitliche technische Spezifikationen für die Überwachung und Meldung von VTEC vorgeschlagen worden. Die Daten, die nach diesen Methoden erhoben werden, sollen eine bessere Analyse innerhalb der EU-Mitgliedstaaten ermöglichen. Da Lebensmittel eine der wichtigsten Quellen für VTEC-Infektionen sind und VTEC der Gruppe O157 bei Infektionen des Menschen die am häufigsten nachgewiesenen Erreger sind, wurden von der EFSA Leitlinien zur Detektion von VTEC O157 in Lebensmitteln vorgeschlagen. Diese Leitlinien können auch zu Detektion andere VTEC Serogruppen angewendet werden wie z. B.: O26, O113, O111 und O145. Der Nachweis von E. coli O157 in Lebensmitteln erfolgt nach dem ISO 16654:2001 Verfahren. Die isolierten O157-Stämme müssen dann mit Hilfe von PCRs auf das Vorkommen von Shigatoxin- (stx1 und stx2) und Intimingene (eae) überprüft werden. Zum Nachweis anderer VTEC-Serogruppen wird die Anwendung des Entwurfs CEN TC275/WG6 vorgeschlagen. Dieser Entwurf liegt für ihre Überprüfung zur Zeit bei der ISO. In diesem Entwurf basiert der Nachweis von VTEC Non-O157 auf herkömmlichen Blockcycler sowie auf Real-Time-PCR Verfahren, gefolgt von einem Bestätigungsschritt zur Isolierung der Stämme. Am NRL-E.coli im BfR sind verschiedene PCR Verfahren zur Detektion und Charakterisierung von VTEC entwickelt und erprobt worden. Die am NRL-E.coli etablierten PCR Methoden sollen mit der im CEN TC275/WG6 Entwurf beschriebenen Technologie verglichen werden um Aussagen zu erzielen, welche Methodik geeigneter ist möglichst alle Varianten von VTEC zu erkennen und ob die in dem ISO CEN Verfahren beschriebene Methodik vom NRL-E

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