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OrbiNet – Molekulare Untersuchungen zur Transmission, Wirtsantwort, Epidemiologie und Diagnostik von Orbiviren
Projekt
Förderkennzeichen: 315858
Laufzeit: 01.05.2011
- 30.04.2014
Forschungszweck: Grundlagenforschung
In einem ersten Projektteil sollen Sequenzveränderungen über die Zeit untersucht werden. Hierfür sollen Protokolle für die direkte Tiefensequenzierung mittels Roche GS FLX etabliert und validiert werden, ebenso wie pan-PCR-Systeme zur Amplifizierung aller 10 Genomsegmente von Orbiviren entwickelt werden. In einem zweiten Projektteil werden die in den Jahren 2007 und 2008 in Deutschland gesammelten Gnitzenpools als Basis für die Entwicklung neuern Multiplex-Tests für den Nachweis von Orbiviren (auch AHS) eingesetzt. Dabei werden die Untersuchungen auch auf andere Vektorspezies erweitert. Arbeiten zur molekularen Diagnostik werden in Kooperation mit Partner 11 stattfinden.In einem abschließenden Projektteil werden reverse genetische Systeme der Orbiviren für die Generierung von sogenannten Reassortanten hergestellt und charakterisiert. Zur besseren Detektion solcher Viren sollen schließlich diagnostische Systeme zur Erkennung entwickelt werden. Für das Projekt ist die Einstellung eines Wissenschaftlers für 3 Jahre vorgesehen. In einem ersten Arbeitschritt werden die entsprechenden Probenmaterialien gesammelt, Komplettgenome sequenziert und PCR-Systeme etabliert (Monat 1 bis 18). In einer zweiten Phase (Monat 19 bis 36) werden in erster Linie reverse genetische Systeme untersucht und die Testsysteme optimiert. Über den gesamten Zeitraum sind abgeschlossene Ergebnisse in Publikationen zusammenzufassen und die Daten mit den anderen Partnern des Konsortiums zu diskutieren. Die geplanten Untersuchungen werden zu wichtigen neuen wissenschaftlichen Erkenntnissen führen, die in Präsentationen und Publikationen national und international vorgestellt werden. Die Arbeiten zur Diagnostik werden in Zusammenarbeit mit der Firma Qiagen durchgeführt und geeignete Testsysteme können direkt in Produkte umgesetzt werden. So sind z.B. real-time RT-PCR Testkits für den Nachweis von AHS oder zur Erkennung von Reassortanten denkbar.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Tiergesundheit