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Kompetenznetzwerk PHÄNOMICS
Verbundprojekt
Laufzeit:
01.02.2010
- 31.01.2015
Koordinierende Einrichtung:
Institut für Nutztierwissenschaften und Technologie
Verbundbereiche
Verbundprojekt 1 - Integrative Bioinformatik
Leitende Einrichtung:
Leibniz-Institut für Nutztierbiologie
Forschungsprojekte
- Animal Trait Ontology - Merkmalsontologie für die Bereiche Verhalten und Wohlbefinden und Projektdatenbank
- Bioinformatik Pipeline zur Integration von Hochdurchsatzdaten und geno-/phänotypischen Parametern in Netzwerk und PNFL Systemmodelle für Rind und Schwein
- Statistische Analyse von Assoziationen zwischen Einzelnukleotidpolymorphismen und Genexpressionen
- Ableitung von Biosignaturen unter Ausnutzung netzwerk-topologischer a-priori Informationen und Profilen verschiedener Ebenen der Genexpression
Verbundprojekt 2 - Phänotypisierung des Verhaltens
Leitende Einrichtung:
Leibniz-Institut für Nutztierbiologie
Forschungsprojekte
- Beeinflussende Faktoren der Verhaltensausprägung beim Schwein
- Analyse individueller Verhaltensmuster (Temperament) beim Rind
- AgroClustEr: Ein systembiologischer Ansatz zur Genotyp-Phänotyp-Abbildung im Kontext von Leistung, Gesundheit und Wohlbefinden bei den Nutztieren Rind und Schwein - Die PHÄNOMICS-Geschäftsstelle.
Verbundprojekt 3 - Integration der OMICS - Ebenen
Leitende Einrichtung:
Genzentrum München
Forschungsprojekte
- Integrative OMICS-Profile zur Definition neuer Phänotypen mit Relevanz für die Merkmalskomplexe Stoffwechsel und Fruchtbarkeit bei Rind und Schwein
- Ingrative OMICS-Profile ausgewählter relevanter Gewebe von Schweinen mit differenter Wachstumleistung und Muskelfleischzusammensetzung
- OMICS-Profile zur Ableitung neuer Selektionskriterien zur Reduktion von Aggression und Verbesserung der Tiergesundheit beim Schwein
- Die OMICS-Verfahren in der Gesundheitsdiagnostik bei Rind und Schwein
Verbundprojekt 4 - Validierung der neuen Phänotypen
Leitende Einrichtung:
Leibniz-Institut für Nutztierbiologie
Forschungsprojekte
- Spezifizierung, Qualifizierung und Validierung prognostischer Parameter für Ressourceneffizienz, Gesundheit und Wohlbefinden beim Schwein
- Spezifizierung, Qualifizierung und Validierung prognostischer Biosignaturen für Milchleistungs-, funktionale und Verhaltensmerkmale beim Rind
- Merkmalsassoziation der Biomarker bei verschiedenen Rinder- und Schweinerassen in unterschiedlichen Produktionsverfahren
- Merkmalsassoziation der Biomarker bei verschiedenen Fütterungseinflüssen
- Robustheit und Merkmalsassoziation der Biosignaturen unter den Bedingungen einer Erregerinfektion
Verbundprojekt 5 - Implementierung der neuen Phänotypen
Leitende Einrichtung:
Institut für Tierzucht und Tierhaltung
Forschungsprojekte
- Entwicklung von modifizierten ,genomic selection\'-Modellen
- Aufbau einer Marker-gestützten Selektionsplattform
- Verfahren zur optimalen Anpaarungsplanung (mate selection) zur Nutzung SNP-basierter Schätzungen nicht-additiver Geneffekte
- Entwicklung eines multidimensionalen Bewertungssystems für die Tiergerechtigkeit mit Hilfe der Multi-Criteria-Analyse (MCA)
- Validierung des entwickelten ,Multi-Criteria-Analyse\'-Systems zur Optimierung tiergerechter Haltungssysteme