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Organisation eines Ringversuchs zur Authentifizierung von Pflanzenproben mittels DNA-Barcoding (Ringversuch Pflanzen-Barcoding)
Projekt
Förderkennzeichen: MRI-NRZ-08-2021-63
Laufzeit: 01.07.2021
- 31.12.2022
Forschungszweck: Experimentelle Forschung
Im Rahmen der § 64 LFGB AG „Molekularbiologische Methoden zur Pflanzen- und Tierartendifferenzierung“ soll ein Ringversuch zur Authentifizierung von Pflanzenproben mittels DNA-Barcoding durchgeführt werden. Das NRZ-Authent übernimmt in Zusammenarbeit mit Dr. Klaus Pietsch vom CVUA Freiburg die Organisation des Ringversuchs, wird am Ringversuch selbst teilnehmen und anschließend die Auswertung des Ringversuchs durchführen.
Insgesamt sollen im Ringversuch die Barcode-Sequenzen für sechs verschiedene genetische Marker bei fünf verschiedenen Pflanzenarten durch eine Polymerase-Kettenreaktion (PCR) mit anschließender Sanger-Sequenzierung bestimmt werden. Die ermittelten DNA-Sequenzen werden mit den Sequenzen in der öffentlichen Nukleotid-Datenbank GenBank und bei zwei Markern zusätzlich in der Barcode of Life Data (BOLD)-Datenbank abgeglichen, um die Spezies der Pflanzenproben zu ermitteln. Ziel des Ringversuchs ist schließlich die Verabschiedung einer Versuchsvorschrift für die Amtliche Sammlung von Untersuchungsverfahren nach § 64 LFGB.
Zunächst wird das NRZ-Authent Vorversuche durchführen, um die Eignung eines der ausgewählten genetischen Marker (ITS1) zu überprüfen, für den bisher in der Unterarbeitsgruppe Pflanzen-Barcoding keine experimentellen Daten ermittelt wurden. Gleichzeitig wird das NRZ-Authent in Zusammenarbeit mit Klaus Pietsch einen Entwurf der Versuchsvorschrift sowie eine Anleitung für die Teilnahme am Ringversuch erstellen. An der Beschaffung der Pflanzenproben, der DNA-Extraktion sowie der Kodierung der Ringversuchsproben ist das NRZ-Authent nicht beteiligt.
Die Auswertung des Ringversuchs geschieht in enger Absprache mit den Mitgliedern der UAG Pflanzen-Barcoding und umfasst einerseits den Vergleich der Ergebnisse der von den Teilnehmerinnen und Teilnehmern ermittelten Datenbank-Abfragen und zusätzlich die Generierung von Konsensus-Sequenzen der einzelnen genetischen Marker sowie deren abschließende Auswertung durch Datenbank-Abfragen in GenBank und BOLD.
Das Projekt gehört zur Daueraufgabe Unterstützung der amtlichen Überwachung bei der Methodenvalidierung ggf. für die Übernahme in die ASU nach § 64 LGFB innerhalb des Themenfeldes Tier-/Pflanzenarten (ggf. Rassen & Sorten) unter dem Aufgabenfeld Analytische Methoden für die Lebensmittel-Authentizitätskontrolle.
Abschnittsübersicht
Fachgebiete
- Verfahrenstechnik Lebensmittel
Förderprogramm
Ausführende Einrichtung
MRI - Nationales Referenzzentrum für authentische Lebensmittel (MRI-NRZ)
